反滲透系統的水源一般為天然水，而天然水中的有機物含量復雜，研究認為，果殼活性炭對分子量在500~3000的有機物有很好的去處效果，對于分子量小于500和大于3000的有機物沒有去除效果。上述果殼活性炭的吸附指標的分子量在200以下，而天然水中有機物主要包括腐植酸、富維酸等物質，其分子量遠遠大于200，故其吸附值不能代表對天然水中有機物的吸附能力。所以在選擇以天然水作為果殼活性炭的進水時，其濾料的選擇與果殼活性炭的吸附碘值的高低等參數沒有多大關系，而與果殼活性炭的過渡孔(過渡孔半徑一般在10～100nm)有多少有關，應選擇過渡孔較高的活性炭，上述三種材質的果殼活性炭以核桃殼和杏殼的過渡孔最多，應選擇核桃殼或杏殼。